獨立式發(fā)酵床也叫異位發(fā)酵床。需要在養(yǎng)豬場的旁邊建設(shè)一個大棚和集污池，一般要求需要5米多寬（因為翻耙機長度為3米），長度根據(jù)養(yǎng)殖量決定（一般存欄500頭豬只要100平方米，平均每頭豬占0.2平方米）。通過各種設(shè)備將糞污收集在集污池中，然后由污泥泵將里面的糞污均勻地分布于預(yù)先鋪設(shè)好的發(fā)酵床墊料中，開動翻耙機耕勻墊料，即進(jìn)入正常運轉(zhuǎn)。它解決了前面兩代技術(shù)中所有的問題，特別是可以人為掌控進(jìn)入墊料中的糞污量。通過良好的管理，死床的現(xiàn)象不會出現(xiàn)；還解決了通過空氣傳播的病害，更規(guī)范，更自動化。并且獨立式發(fā)酵床墊料的原料選擇非常的廣泛，墊料消耗少，可持續(xù)使用2年。

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新技術(shù)需要增加設(shè)施，在管理上需要盡量減少沖欄水，減少發(fā)酵床的壓力，設(shè)置飲水防漏水裝置等，使漏水能留到另外的集污池；要增設(shè)集污攪拌池、污泥泵和輸送管道、自動翻耙機、糞污噴淋設(shè)備等；以及飲水器**適當(dāng)改進(jìn)，讓漏嘴水另外分流；現(xiàn)代化的集“翻耙-布污”一體化的設(shè)備有等完善。

獨立式發(fā)酵床墊料的原料選擇非常的廣泛，各種墊料，如秸稈、木屑、花生殼；墊料消耗少（每頭豬消耗墊料0.04立方米），使用成本低，平均一頭豬從出生到出欄大概只需要1.2～1.8元的菌種成本，如果加上墊料的成本大概5塊錢左右。

冬天或者初次建設(shè)時，在墊料中補充能量如玉米粉100克/平方米或葡萄糖50克/平方米。獨立式發(fā)酵床墊料厚度為50～100公分，在北方越厚越好，有自我保溫性能，但翻耙機必須**翻耙70%以上深度。

獨立式發(fā)酵床墊料中95%的水分是揮發(fā)到空氣中去的，所以需要定期打開來排氣，尤其冬天，在中午打開塑料卷棚適當(dāng)排氣。發(fā)酵床墊料中的氮主要是通過菌種反硝化細(xì)菌脫氮變成無色無味的氮氣揮發(fā)到空氣。雖然減少了糞污的肥效，但同時也減少了對土地的硝化面積。在此，鐘啟平還給我們介紹了新一代“反硝化脫氮-酸化-脫硫-解磷”發(fā)酵床復(fù)合型菌種，該菌種含有：屎腸球菌、糞腸球菌、反硝化細(xì)菌、硫化物氧化細(xì)菌、解磷解鉀菌、產(chǎn)朊假絲酵母、適當(dāng)?shù)牡匾卵挎邨U菌、枯草芽孢桿菌、以及高活力酶制劑，各菌種都具有各自的優(yōu)勢，達(dá)到多菌協(xié)調(diào)增效的作用，具有分解糞便能力強的優(yōu)勢。