好氧菌是經過人工挑選馴化的多種需氧微生物的總稱，主要包含硝化細菌屬、反硝化細菌屬、芽孢桿菌屬、假單胞菌屬和活化酶以及多糖等其它營養物。好氧菌在污水處理上投加在好氧池，用來提高COD、BOD、氨氮、總磷等的去除率。好氧菌能夠分解表面活性劑、碳氫化合物、酚類化合物、蛋白所以及不易分解的有機物，把它們**終分解成二氧化碳和水等小分子物質。